L'axe ECOS s'intéressera aux interactions chimiques entre le microbiome fongique et sa plante hôte. L'un des objectifs sera d'identifier une nouvelle source renouvelable de composés antiinfectieux d'origine naturelle. Un deuxième objectif consistera à étudier la dynamique des populations fongiques présentes dans certaines pseudo-céréales de la zone andine au Pérou, suspectées de libérer des mycotoxines à l'origine d'hépatocarcinomes cellulaires observés dans ces régions. Enfin, en vue de valorisation, l'étude de la biogenèse de l'indigo sera poursuivie en déterminant l'implication possible de microorganismes endophytes dans le processus de dimérisation de l'indigo.
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